主办单位:黑龙江省教育厅、哈尔滨医科大学培训地点:中国·哈尔滨
培训时间:2015年7月1日至3日
报到时间:2015年6月30日全天
报名网址:http://bioinfo.hrbmu.edu.cn/training/2015training.jsp
培训主题:生物信息学基础与转化技术
哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院是我国最大规模的生物信息学科研和人才培养单位之一,生物信息学与计算系统生物学研究实力处于国内前列,计算生物学人才培养质量和数量居国内领先水平。生物信息学作为当前高新热点领域之一,与现代生物医药发展存在密切联系,对科研成果向经济产业转化具有重大的推动意义,并对培养具备高素质理工科创新思维和生物医药分析能力相融合的战略性紧缺人才提出了挑战。在黑龙江省教育厅资助下,哈医大生物信息科学与技术学院主办“哈尔滨医科大学2015年全国生物信息学暑期学校”,旨在带给全国相关领域大学生、研究生系统接触生物信息学的机会,为推进我国现代创新型生物医药人才培养创造条件。同时,以暑期学校为平台邀请全国各高校相关专业在校本科学生参加“2015年生物信息学转化技术夏令营”,通过广泛的学习交流,双向选择,选拔优秀学员攻读学院或哈尔滨医科大学研究生。
日程安排:
1.暑期学校培训
1)7月1日上午8:30-9:00暑期学校开幕式
2)7月1日上午9:30-7月2日下午17:00课程培训
2.夏令营专题交流
7月3日上午8:30-11:30生物信息学转化技术专题交流会
培训内容:
1.重大疾病的生物信息学概述(李霞教授)7月1日上午
2.基因芯片数据分析(姜伟教授)7月1日上午、下午
1)基因芯片数据的获取
2)基因芯片数据的预处理
3)差异表达基因筛选
4)聚类与分类
上机实践:
1) ArrayTools软件介绍及使用
3.基因功能分析技术(许超汉副教授)7月1日下午
1)常用的功能数据库简介
2)基因的功能注释与富集分析
3)疾病基因功能分析技术
上机实践:
1) DAVID、
2)疾病风险基因的功能注释和富集分析
4.基因通路分析技术(韩俊伟博士)7月2日上午
1)常用的通路数据库简介
2)基因的通路的富集分析
3)疾病风险通路和子通路识别技术
上机实践:
1)通路富集分析技术:DAVID,GSEA方法应用
2)基于通路结构识别疾病风险通路:SPIA
3)疾病的风险子通路识别:SubpathwayGM
5.生物分子网络分析与特征基因筛选(宁尚伟副教授)7月2日上午
1)生物分子网络简介和分子网络资源
2)生物分子网络的构建和基本性质分析
3)疾病相关分子生物网络的构建和分析方法
上机实践:
1) Cytoscape介绍及使用
2)基于分子网络分析的冠心病风险基因识别
6.复杂疾病相关ncRNA的识别及功能分析(徐娟副教授)7月2日下午
1) ncRNA的类型及相关数据资源
2)疾病相关ncRNA的识别
3) ncRNA的调控机制及功能
上机实践:
1) ncRNA常用网络资源
2)疾病相关ncRNA的功能分析
7.复杂疾病与表观遗传分析(李永生博士)7月2日下午
1)表观遗传学简介及相关数据资源
2)复杂疾病的表观遗传学分析
3)非编码RNA的表观遗传学调控分析
上机实践:
1)基于DNA甲基化芯片识别复杂疾病的分子标记
8.新一代测序技术(肖云副教授)7月3日上午
1)新一代测序技术原理
2)新一代测序数据(RNA-seq)获取与处理
3)新一代测序数据的复杂疾病分析
上机实践:
1)复杂疾病RNA-seq数据分析
招生对象:
面向全国计算机、数学、生命科学、医学、药学、农林科学及相关专业本科生、研究生招收学员150名,其中夏令营学员50名,视具体报名情况可适当增加名额。夏令营学员一般应为2016年或2017年应届本科毕业生,年龄不超过25周岁,品学兼优,并且有继续深造的意愿,报到时根据网站提示带齐相关资料。
录取原则:
根据报名时间、专业背景和申请意愿择优录取,兼顾不同省份城市和学校名额均衡。完成全部课程的学员将获得哈尔滨医科大学研究生学院出具的学分证明。有意愿报考哈尔滨医科大学2016年研究生的夏令营学员可在交流过程中,通过面试,确定录取意向。
培训费用:
免培训费,并免费提供培训所需的资料,其他交通费用和食宿安排自理。考虑到夏令营本科生学员缺乏经费支持,会务组将为每位夏令营学员提供一定的伙食补助,外地市夏令营学员可申请交通补助(学员学校所在地至哈尔滨火车硬座或动车二等座车票,500元以内),及申请入住哈医大研究生公寓(费用由会务组解决)。
授课方式:
为达到最佳授课效果,为每位学员配备一台高性能计算机和集群使用帐号(按报到先后分配机位,走读学员自带笔记本电脑),采用理论教学、上机实践与解决实际问题相结合的方式进行授课,并就学员感兴趣的问题进行深入探讨。
报名方法:
即日起采用网上报名方式,详细填写各项内容,填写内容和报名时间将作为主要的录取依据,报名截止日期2015年6月20日。录取结果将陆续于报名网站公布,同时发送邮件至申请人邮箱。
报名网址:http://bioinfo.hrbmu.edu.cn/training/2015training.jsp
报到事项:
2015年6月30日8:00-20:00和7月1日上午8:30前,学员自行至哈尔滨医科大学分子生物学馆大厅报到、领取材料,并按报到时间分配机位。
哈尔滨医科大学地址:哈尔滨市南岗区保健路157号。机场打车费130元左右;哈尔滨火车站可乘坐11、88、94、343路公交车至“医科大学”站下车;乘坐动车的学员到达后可乘坐218路公交车至“医科大学”站,打车为起步价。
联系方式:
咨询电话:0451-86669617 0451-86650721-16 0451-86667543
邮箱地址:bioinfo@hrbmu.edu.cn 联系人:徐老师、许老师